Η πόλη και η περιοχή διαθέτουν πολλά αξιοθέατα που προσελκύουν πολλούς επισκέπτες, ιδιαίτερα κατά τους καλοκαιρινούς μήνες. Από τους ναούς της πόλης αξίζει να επισκεφτείτε τον Άγιο Σπυρίδωνα, τον ιστορικό τόπο που κηρύχθηκε η ένωση της Σάμου με την Ελλάδα στις 11 Νοεμβρίου 1912, τον Μητροπολιτικό Ναό του Αγίου Νικολάου, τον Άη Γιαννάκη με την ιδιαίτερη αρχιτεκτονική στο Άνω Βαθύ, την Αγία Ειρήνη, τις τρεις εκκλησίες πάνω από το Βαθύ. Έξω από την πόλη σε απόσταση 7 χιλιόμετρα βορειοανατολικά βρίσκεται η Ιερά Μονή της Ζωοδόχου Πηγής του 18ου αιώνα και κοντά της το μνημείο των ιερολοχιτών που έπεσαν σε μάχες κατά των κατακτητών το 1943. Επίσης 5 χιλιόμετρα ανατολικά βρίσκεται η Ιερά Μονή της Αγίας Ζώνης του 17ου αιώνα με ωραίες σωζόμενες αγιογραφίες και περίτεχνο ξυλόγλυπτο τέμπλο.

Από τα κτίρια και τα άλλα μνημεία αξίζει να επισκεφτείτε και να δείτε το Δημαρχιακό Μέγαρο όπου στεγάστηκε η Βουλή των Σαμίων και σήμερα εκτός από το δημαρχείο φιλοξενεί και την Πινακοθήκη που ανάμεσα στα άλλα φυλάσσονται πολλά ιστορικά κειμήλια των νεώτερων χρόνων. Ανάμεσα στα σπουδαιότερα είναι το Σύνταγμα της Ηγεμονικής Σάμου, πολλές προσωπογραφίες ηγεμόνων και άλλων προσωπικοτήτων της πολιτικής, οικονομικής και κοινωνικής ζωής του νησιού, πολλά ιστορικά ψηφίσματα των πάντα επαναστατημένων Σαμίων και άλλα πολλά. Επίσης πρέπει να επισκεφτείτε και το Πασχάλειον Αρχαιοφυλάκειον δηλαδή το παλιό μουσείο της πόλης, την Δημόσια Κεντρική Βιβλιοθήκη με μεγάλες συλλογές από έντυπο υλικό μεγάλης ιστορικής αξίας, το εντυπωσιακό μνημείο του Λιονταριού στην πλατεία Πυθαγόρα, τα παλιά και ανακαινισμένα κτίρια της Εθνικής και της Εμπορικής Τράπεζας, τον ανδριάντα του Θεμιστοκλή Σοφούλη στην προκυμαία και τις παλίες Καπναποθήκες. Ακόμα αξιοθέατο είναι ολόκληρος ο οικισμός Παλαιό Βαθύ με παραδοσιακή αρχιτεκτονική και ωραία θέα προς το λιμάνι.

Άλλα αξιόλογα για να δει ο επισκέπτης είναι το υπαίθριο θεατράκι δίπλα στην εκκλησία του Άη Γιαννάκη και το παλιό Δημοτικό Σχολείο.

Έξω από την πόλη εκτός από τα μοναστήρια μπορεί να επισκεφτεί κάποιος και τον παραθεριστικό οικισμό της Ψιλής Άμμου με την ωραία αμμουδιά και εκεί κοντά τον σπουδαίο υγροβιότοπο της Αλυκής, το Ηρώο των Πεσόντων Σαμίων στην Μικρά Ασία στο ύψωμα πάνω από την Αλυκή κοντά στο εκκλησάκι του Αγίου Χριστόφορου και τους γραφικούς παραθαλάσσιους οικισμούς Κλήμα και Ποσειδώνιο περιοχές με ωραίες ακρογιαλιές.

Tέλος στην πόλη της Σάμου λειτουργούν και δυο πολύ σημαντικά μουσεία. Το Αρχαιολογικό και το Μουσείο Σαμιακού Οίνου στη τοποθεσία «Μαλαγάρι» που στεγάζεται σε παραδοσιακό ανακαινισμένο κτίριο και ιδρύθηκε από την Ένωση οινοποιητικών Συνεταιρισμών Σάμου